MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii SDF plasmid p1ABSDF

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010395	A	7	7	472	478	100 %	0 %	0 %	0 %	169302964
2	NC_010395	GAA	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302964
3	NC_010395	TTG	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302964
4	NC_010395	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302964
5	NC_010395	AAC	2	6	557	562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
6	NC_010395	AC	3	6	602	607	50 %	0 %	0 %	50 %	169302964
7	NC_010395	AACT	2	8	737	744	50 %	25 %	0 %	25 %	169302964
8	NC_010395	TAA	2	6	767	772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302964
9	NC_010395	TGA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
10	NC_010395	TGT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302964
11	NC_010395	AGT	2	6	901	906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
12	NC_010395	GTA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302964
13	NC_010395	AGA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302964
14	NC_010395	AAC	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
15	NC_010395	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302964
16	NC_010395	ACA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302964
17	NC_010395	CTT	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302964
18	NC_010395	AG	3	6	1369	1374	50 %	0 %	50 %	0 %	169302964
19	NC_010395	TCGT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	169302965
20	NC_010395	T	6	6	1465	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	169302965
21	NC_010395	TTCT	2	8	1570	1577	0 %	75 %	0 %	25 %	169302965
22	NC_010395	T	6	6	1618	1623	0 %	100 %	0 %	0 %	169302965
23	NC_010395	TTTTC	2	10	1639	1648	0 %	80 %	0 %	20 %	169302965
24	NC_010395	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
25	NC_010395	GTA	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
26	NC_010395	CCA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302966
27	NC_010395	GAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
28	NC_010395	AGT	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302966
29	NC_010395	ATA	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302966
30	NC_010395	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
31	NC_010395	CCAAA	2	10	2146	2155	60 %	0 %	0 %	40 %	169302966
32	NC_010395	CAT	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
33	NC_010395	CCCA	2	8	2365	2372	25 %	0 %	0 %	75 %	169302966
34	NC_010395	T	6	6	2427	2432	0 %	100 %	0 %	0 %	169302966
35	NC_010395	CAT	2	6	2434	2439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
36	NC_010395	TAC	2	6	2471	2476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302966
37	NC_010395	GATC	2	8	2481	2488	25 %	25 %	25 %	25 %	169302966
38	NC_010395	ATT	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302966
39	NC_010395	CTT	3	9	2521	2529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302966
40	NC_010395	A	6	6	2652	2657	100 %	0 %	0 %	0 %	169302966
41	NC_010395	CAAA	2	8	2659	2666	75 %	0 %	0 %	25 %	169302966
42	NC_010395	TGG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302967
43	NC_010395	CTT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302967
44	NC_010395	AAC	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302967
45	NC_010395	TTG	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302967
46	NC_010395	CAT	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302967
47	NC_010395	ATG	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302967
48	NC_010395	TG	4	8	3035	3042	0 %	50 %	50 %	0 %	169302967
49	NC_010395	TATAA	2	10	3157	3166	60 %	40 %	0 %	0 %	169302968
50	NC_010395	A	7	7	3188	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
51	NC_010395	A	7	7	3225	3231	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
52	NC_010395	T	7	7	3253	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	169302968
53	NC_010395	T	6	6	3266	3271	0 %	100 %	0 %	0 %	169302968
54	NC_010395	ATA	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
55	NC_010395	A	6	6	3348	3353	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
56	NC_010395	TAA	2	6	3369	3374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
57	NC_010395	A	7	7	3373	3379	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
58	NC_010395	TCA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302968
59	NC_010395	AT	3	6	3459	3464	50 %	50 %	0 %	0 %	169302968
60	NC_010395	AT	3	6	3467	3472	50 %	50 %	0 %	0 %	169302968
61	NC_010395	TAAA	2	8	3478	3485	75 %	25 %	0 %	0 %	169302968
62	NC_010395	A	8	8	3488	3495	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
63	NC_010395	A	6	6	3544	3549	100 %	0 %	0 %	0 %	169302968
64	NC_010395	TAA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302968
65	NC_010395	T	6	6	3569	3574	0 %	100 %	0 %	0 %	169302969
66	NC_010395	GCC	2	6	3612	3617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169302969
67	NC_010395	CCCA	2	8	3632	3639	25 %	0 %	0 %	75 %	169302969
68	NC_010395	TGAG	2	8	3677	3684	25 %	25 %	50 %	0 %	169302969
69	NC_010395	TCC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
70	NC_010395	CCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
71	NC_010395	ACC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
72	NC_010395	TCT	2	6	3787	3792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
73	NC_010395	CCA	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302969
74	NC_010395	T	6	6	3896	3901	0 %	100 %	0 %	0 %	169302969
75	NC_010395	CCT	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
76	NC_010395	CTC	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
77	NC_010395	GATT	2	8	3952	3959	25 %	50 %	25 %	0 %	169302969
78	NC_010395	TTC	2	6	3965	3970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
79	NC_010395	TTG	2	6	3976	3981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302969
80	NC_010395	CTC	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
81	NC_010395	ATTC	2	8	4152	4159	25 %	50 %	0 %	25 %	169302969
82	NC_010395	CCT	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302969
83	NC_010395	GAT	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302969
84	NC_010395	ATT	2	6	4278	4283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302969
85	NC_010395	AT	3	6	4289	4294	50 %	50 %	0 %	0 %	169302969
86	NC_010395	CAT	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
87	NC_010395	A	7	7	4337	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	169302969
88	NC_010395	GAA	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302969
89	NC_010395	CTT	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
90	NC_010395	TCT	2	6	4396	4401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
91	NC_010395	CTT	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
92	NC_010395	CTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302969
93	NC_010395	T	6	6	4428	4433	0 %	100 %	0 %	0 %	169302969
94	NC_010395	TGT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302969
95	NC_010395	AAC	3	9	4473	4481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302969
96	NC_010395	T	6	6	4572	4577	0 %	100 %	0 %	0 %	169302969
97	NC_010395	TTAA	2	8	4618	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	169302969
98	NC_010395	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
99	NC_010395	TAAA	2	8	4650	4657	75 %	25 %	0 %	0 %	169302969
100	NC_010395	GAA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302969
101	NC_010395	ATC	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302969
102	NC_010395	T	7	7	4871	4877	0 %	100 %	0 %	0 %	169302969
103	NC_010395	TAG	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302969
104	NC_010395	ATT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302969
105	NC_010395	CAA	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302969
106	NC_010395	TTC	2	6	4983	4988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302970
107	NC_010395	CTGT	2	8	4991	4998	0 %	50 %	25 %	25 %	169302970
108	NC_010395	CTT	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302970
109	NC_010395	TCAT	2	8	5020	5027	25 %	50 %	0 %	25 %	169302970
110	NC_010395	GTT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302970
111	NC_010395	TCA	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302970
112	NC_010395	AT	3	6	5191	5196	50 %	50 %	0 %	0 %	169302970
113	NC_010395	AGA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302970
114	NC_010395	GCCA	2	8	5337	5344	25 %	0 %	25 %	50 %	169302970
115	NC_010395	ACA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971
116	NC_010395	GAA	2	6	5505	5510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302971
117	NC_010395	ACA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971
118	NC_010395	AGA	2	6	5765	5770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302971
119	NC_010395	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302971
120	NC_010395	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302971
121	NC_010395	AT	3	6	5998	6003	50 %	50 %	0 %	0 %	169302971
122	NC_010395	T	6	6	6003	6008	0 %	100 %	0 %	0 %	169302971
123	NC_010395	AAC	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302971

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.